Reglerande faktor
•
Ribonukleinsyra, som förkortas RNA (av engelskans ribonucleic acid), är en makromolekyl som finns i alla levandeorganismer. Hos levande celler finns det genetiska materialet i form av den besläktade, mer stabila molekylen dna, medan RNA återfinns i mer kortlivade molekyler. En del virus har sitt genom uppbyggt av ribonukleinsyra, exempelvis hiv.
Molekylen är uppbyggd som en kedja av sammankopplade nukleotider. Varje nukleotid består av en sockermolekyl, ribos, en fosfatgrupp och en kvävebas som kan vara av fyra olika slag. I RNA betecknas kvävebaserna med första bokstaven i namnen: A för adenin, U för uracil, G för guanin och C för cytosin. RNA-molekylen är oftast enkelsträngad, till skillnad från dna-dubbelspiralen som består av två kedjor.
Olika typer av RNA har olika biologiska funktion. De vanligaste formerna av RNA är:
Genom är inom genetiken beteckningen på en organisms ärftliga information kodad i DNA, det vill säga den fullständiga DNA-sekvensen i en uppsättning av organismens olikakr
•
PLOS ONE: single nucleotide polymorphisms inom Interferon signalväg Gener är associerade med kolorektal cancer Känslighet och Survival
Abstrakt
Interferon (IFN) signalering har föreslagits att spela en viktig roll i kolorektal karcinogenes. Vår studie syftar till att undersöka potentiellt funktionella genetiska varianter i interferon reglerande faktor 3 (
IRF3
),
IRF5
,
IRF7
, typ I och typ II
IFN
och deras receptorgener med avseende på kolorektal cancer (CRC) risk och kliniskt utfall. Sammanlagt 74 single nucleotide polymorphisms (SNP) täcktes av de 34 SNP genotypats i en sjukhusbaserad fall-kontrollstudie av CRC fall och friska kontrollpersoner från Tjeckien. Vi analyserade även dessa SNP i förhållande till total överlevnad och händelse överlevnad i en subgrupp av patienter. Sju SNP i
IFNA1
,
IFNA13
,
IFNA21
,
IFNK
,
IFNAR1 Mössor och
IFNGR1
var förknippade med CRC risk. Efter korrigering flera tester, de föreningar med SNP rs (
IFNAR1
) och rs (
IFNGR1
) förblev formellt signifikant (
P
= 0, och
P
& lt; 0,, respektive). Multivariabla överlevnad analyser visade att SNP rs (
IFNA7 /IFNA14
) var associerad med överlevnad av patienterna (
P
= 0, och hä
•
PLOS ONE: modifierad Expression från hypoxi-inducerbara faktor-1α (HIF-1α) samt dess reglerande gener inom Gastric Cancer Tissues
Abstrakt
hypoxi inducerar omprogrammering av cellmetabolism och är kapabel resultera inom normal celltransformation och cancer progression. Hypoxi-inducerbara faktorn 1-alfa (HIF-1α), nyckeln transkriptionsfaktorn, agerar en nödvändig roll nära gastrisk cancerutveckling och progression. Denna undersökning syftade mot att undersöka den underliggande reglerande signalväg i magcancer med hjälp av magcancer vävnadsprover. Integrationen av genuttryck profil samt transkriptionsregulatoriskt element databas (TRED) fortsatte för att identifiera HIF-1α ↔ NFκB1 → BRCA1 → STAT3 ← STAT1 gen vägar och deras reglerade gener. Data visade att detta fanns 82 differentiellt uttryckta gener likt kan regleras av dessa fem transkriptionsfaktorer i magcancer vävnader samt dessa gener bildade 95 reglerlägen, varav sju gener (MMP1, TIMP1, TLR2, FCGR3A, IRF1, FAS, och TFF3 ) fanns nav molekyler som regleras åtminstone numeriskt värde av dessa fem transkriptionsfaktorer samtidigt samt var förknippade med hypoxi, inflammation samt immunstörning. Real-Time PCR samt Western blöt visade ökningen av HIF-1α i mRNA och proteinnivåe